来源： 克里斯托弗·图马吉安, 785-532-0879 或 js3845金沙线路检测中心omajia@k-state.edu;
和凯蒂js3845金沙线路检测中心, klh2@js3845金沙线路检测中心.edu
发音者： js3845金沙线路检测中心omajian 是五月一月
家乡兴趣： 斯塔福德和斯塔福德县, 坎.
新闻稿准备者： 詹妮弗·蒂德博尔, 785-532-0847, jjs3845金沙线路检测中心rline@k-state.edu
星期四, 九月. 1, 2011
映射模型：js3845金沙线路检测中心人员的国际合作到测序, 分析期刊中出现的植物物种基因组
曼哈顿 - 两名js3845金沙线路检测中心立大学的研究人员一直在合作开展一个国际项目，该项目涉及模型植物物种的基因组，该项目可以提供对其他植物的深入了解.
克里斯托弗·图马吉安, js3845金沙线路检测中心病理学助理教授, 和凯蒂希尔德布兰德, js3845金沙线路检测中心病理学博士生, 斯塔福德， 正在js3845金沙线路检测中心拟南芥的遗传变异, 生命周期短的小型开花植物, 使其成为科学js3845金沙线路检测中心的最佳模式物种之一.
他们的一些最新js3845金沙线路检测中心, 他们与犹他大学的js3845金沙线路检测中心人员合作, 英国和德国. 他们的协作工作, 标题为“拟南芥的多个参考基因组和转录组,”在线发表在《自然》杂志上，重点关注拟南芥基因组的测序和分析.
通过了解拟南芥等模式物种的基因组成, js3845金沙线路检测中心人员可以更好地了解其他植物的工作原理和行为.
“这是对基因组如何在js3845金沙线路检测中心中发挥作用以及同一物种个体之间差异的相关性有更深入了解的一部分,”图马吉安说.
这篇文章有双重意义：它包含来自英国研究人员的数据，他们对拟南芥的 18 个基因组进行了测序. 但它也包括其他群体的分析, 包括js3845金沙线路检测中心立大学的研究人员, 谁查看了转录数据——这些数据显示了基因组中 DNA 被转化为 RNA 的位置，以便它可以在植物中表达为功能性蛋白质.
拟南芥基因组于 2000 年完成测序, 使其成为第一个进行基因组测序的js3845金沙线路检测中心.
“从我们的意义上来说，js3845金沙线路检测中心拟南芥的人们已经遥遥领先, 至少对于一株植物, 整个基因组已有十多年的历史，我们已经能够预测其编码的大部分基因和蛋白质,”图马吉安说. “近年来人们所做的事情已经超越了单一基因组序列, 因为一个参考序列无法准确预测一个物种内发现的所有变异的后果."
《自然》杂志文章中介绍的部分js3845金沙线路检测中心是美国国家科学基金会正在进行的一项价值超过 700 美元的资助的成果,000. Toomajian 是犹他大学js3845金沙线路检测中心员理查德·克拉克 (Richard Clark) 的联合首席js3845金沙线路检测中心员. 希尔德布兰德正在帮助进行js3845金沙线路检测中心.
“我一直对遗传学以及变异和表达感兴趣, 所以我发现这个项目非常令人兴奋,”js3845金沙线路检测中心说.
作为项目的一部分, 克拉克从拟南芥植物中收集基因表达数据，并将其发送给德国马普学会弗里德里希·米歇尔实验室的 Gunnar Ratsch 小组进行分析. Toomajian 和 Hildebrand 参与了合作者 Richard Mott 的基因组序列数据分析, 牛津大学威康人类遗传学信托中心的js3845金沙线路检测中心员. K-State js3845金沙线路检测中心人员还致力于将序列变异数据与分析的基因表达数据进行比较.
他们迄今为止涉及拟南芥幼苗的工作出现在《自然》杂志的文章中. 他们现在希望从拟南芥花芽和根中获得类似的基因表达数据，以便了解不同js3845金沙线路检测中心组织中基因表达的变化. 最终团队希望了解基因表达模式是否特定于js3845金沙线路检测中心生长的不同阶段, 从幼苗到花和根, 物种内也是可变的.
“人们已经开始意识到，物种内部的差异或物种之间发生的变化往往不仅仅是蛋白质序列的变化,”图马吉安说. “这些基因的时序也可能导致js3845金沙线路检测中心的工作和行为发生许多重要的功能变化. 我们正试图弄清楚良好模式js3845金沙线路检测中心物种中基因表达的一些差异的相关性."
