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金沙js4399首页人员绘制了世界小麦品种的详细遗传图谱

星期五, 3 月 20 日, 2015

Haplotype map team

金沙js4399首页立大学研究人员正在发布一项研究,详细介绍了小麦的第一个单倍型图. 该图谱是改良世界各地小麦品种的基因突破. 这项研究由爱德华·阿胡诺夫 (Eduard Akhunov) 领导, 植物病理学副教授, 中心, 和凯瑟琳·乔丹, 左, 和王世辰, 研究员和主要作者. | 下载下面的照片.


曼哈顿 — 金沙js4399首页立大学的科学家发布了一种复杂的发现, 对小麦基因组多样性进行的为期两年的研究为未来世界各地小麦的改良奠定了重要基础.

他们的工作产生了第一个小麦单倍型图,该图提供了全球小麦品系样本中遗传差异的详细描述. 遗传学, 单倍型图谱是将序列水平变异转移到多个金沙js4399首页作图项目的强大工具.

“所有这些都是新的, 基于金沙js4399首页的育种策略有望显着加快育种周期并缩短未来小麦品种的发布时间,”说 爱德华·金沙js4399首页, 金沙js4399首页、项目负责人.

植物科学家经常研究生物体的金沙js4399首页成,以培育特定的新品种, 理想的特质, 比如干旱, 抗虫或抗病. Akhunov 说单倍型图谱让科学家能够快速获取丰富的信息, 提高小麦金沙js4399首页中基因定位精度的遗传变异数据, 并提高科学家在育种试验中选择最佳品系的能力.

阿胡诺夫的研究员, 凯瑟琳·乔丹和王世辰, 是该研究的主要作者, “异源六倍体小麦的单倍型图谱揭示了同源基因组上不同的选择模式,”将发表在即将出版的《基因组生物学》杂志上. 该项目是通过国际小麦基因组测序联盟协调的, 以及加拿大境内的团体, 澳大利亚, 美国.K. 和美国.S. 大部分工作在金沙js4399首页立大学的综合基因组设施中进行.

这项金沙js4399首页包括来自世界各地的 62 个小麦品系,它们要么是现代栽培品种,要么是之前未通过正规育种技术改良的品种, 称为地方品种.

降低小麦金沙js4399首页的复杂性, 研究小组开发了一种名为“外显子组捕获测定”的工具,仅对较大小麦金沙js4399首页的功能部分进行靶向测序. 该技术绕过了金沙js4399首页中重复的部分, 根据阿胡诺夫的说法.

科学家发现1.金沙js4399首页中有 600 万个位置(称为单核苷酸多态性),其中小麦品系彼此不同. 研究小组利用这些信息描述了这些差异对数万个小麦基因功能的影响.

“一旦控制农艺性状的金沙js4399首页被确定, 它们不仅可以使用传统的育种方法来改良小麦, 还有基于生物技术和分子生物学的新策略,”阿胡诺夫说.

“未来, 我们将扩大使用我们的测序策略表征的小麦品系集,不仅包括更多遗传和地理上多样化的小麦品系, 还包括小麦的近亲和远亲,”他说. “这些小麦近亲因蕴藏着宝贵的农业金沙js4399首页而闻名,这些金沙js4399首页可以提高非生物和生物胁迫耐受性或其他品质性状, 并提高产量."

Akhunov 表示,基于基因组学的方法现已被引入全球每一个小麦育种计划. “我确信我们将在三到五年内看到金沙js4399首页立大学开发的多样性资源对小麦育种的影响,”他说.

除了乔丹和王, 金沙js4399首页立大学研究团队包括 Alina Akhunova 和 Yanni Lun, 谁协调了综合基因组学设施的工作; 和植物病理学教员 Christopher Toomajian.

“如果没有 K-State Research and Extension 开发的计算和基因组基础设施,这项研究是不可能完成的, 过去五到七年农学院和金沙js4399首页立大学,”阿胡诺夫说.

这项金沙js4399首页的资金由美国大学提供.S. 农业部国家食品和农业金沙js4399首页所通过国家金沙js4399首页计划.

来源

爱德华·金沙js4399首页
785-532-1342
eakhunov@k-state.金沙js4399首页u

发音者

爱德华是 金沙js4399首页-WARD
金沙js4399首页 是 awk-HOO-NAHV

金沙js4399首页

帕特·梅尔加雷斯
785-532-1160
melgares@k-state.金沙js4399首页u

概览

金沙js4399首页立大学的研究人员制作了第一个小麦单倍型图,该图提供了全球小麦品系样本中遗传差异的详细描述. 单倍型图谱是将序列水平变异转移到多个基因作图项目的强大工具. 这是未来世界各地小麦改良的重要基础.

值得注意的引言

“未来, 我们将扩大使用我们的测序策略表征的小麦品系集,不仅包括更多遗传和地理上多样化的小麦品系, 还包括小麦的近亲和远亲. 这些小麦近亲因蕴藏着宝贵的农业金沙js4399首页而闻名,这些金沙js4399首页可以提高非生物和生物胁迫耐受性或其他品质性状, 并提高产量."

— 爱德华·金沙js4399首页, 植物病理学副教授