科学家完成了基于染色体的金沙城js9线路检测中心基因组草图
星期四, 金沙城js9线路检测中心 17 日, 2014
曼哈顿 — 金沙城js9线路检测中心立大学的几位研究人员在帮助科学家起草面包小麦基因蓝图方面发挥了重要作用, 也称为普通小麦. 该食品工厂在全球种植面积超过 5.31 亿英亩,每年生产近 7 亿吨食品.
国际小麦基因组测序联盟, 其中还包括金沙城js9线路检测中心立大学的教师, 最近发表了基于染色体的小麦遗传密码序列草案, 称为基因组. “基于染色体的六倍体面包小麦基因组序列草案”是该杂志上发表的四篇关于小麦基因组的论文之一 金沙城js9线路检测中心.
金沙城js9线路检测中心蓝图对于植物科学研究人员和育种者来说是宝贵的资源, 说 爱德华·金沙城js9线路检测中心, 植物病理学副教授,国际金沙城js9线路检测中心基因组测序联盟合作者.
“第一次, 他们拥有一套可供使用的工具,使他们能够快速定位整个基因组中单个金沙城js9线路检测中心染色体上的特定基因,”阿胡诺夫说. “该资源对于识别控制复杂性状的基因非常宝贵, 如产量, 谷物品质, 疾病, 害虫抗性和非生物胁迫耐受性. 他们将能够生产产量更高、可持续性更强的新一代金沙城js9线路检测中心品种,以满足不断变化的环境中不断增长的世界人口的需求."
虽然是草稿, 该序列提供了对植物结构的新见解, 组织, 进化和金沙城js9线路检测中心复杂性.
“这对于金沙城js9线路检测中心遗传学和育种界来说是一个非常重大的进步,”阿胡诺夫说. “金沙城js9线路检测中心基因组序列为研究遗传变异和了解遗传密码的变化如何影响重要农艺性状提供了基础. 在我们的实验室中,我们使用此序列创建了全球金沙城js9线路检测中心品系样本 DNA 序列中单碱基变化的目录,以深入了解金沙城js9线路检测中心遗传多样性的进化和起源."
金沙城js9线路检测中心, 王世辰, 植物病理学领域的程序员和生物信息学金沙城js9线路检测中心,并且 杰西波兰, 植物病理学助理教授, 与国际金沙城js9线路检测中心基因组测序联盟合作,对金沙城js9线路检测中心染色体上的基因进行排序.
参与的金沙城js9线路检测中心立大学植物病理学系的其他研究人员包括 比克拉姆·吉尔, 金沙城js9线路检测中心杰出教授兼主任 js金沙城js9线路检测中心3983总站 成功的候选人将加入一个充满活力的研究团队,金沙城js9线路检测中心贝恩德·弗里贝, 研究教授. 小麦遗传资源中心提供了用于分离小麦基因组染色体序列的所有遗传物质. 开发该项目所需的足够种子材料需要种植遗传资源金沙城js9线路检测中心立大学温室和田间自 2008 年起. 这是在以下人员的监督下完成的: 杜安·威尔逊, 副金沙城js9线路检测中心,并且苏尼什·塞加尔,资深金沙城js9线路检测中心。
《科学》杂志上的第二篇论文详细介绍了 3B 号染色体的第一个参考序列, 普通金沙城js9线路检测中心中最大的染色体.
“金沙城js9线路检测中心基因组只有 21 条染色体, 但每条染色体都很大,因此相当复杂,”阿胡诺夫说. “最大的染色体, 3B, 遗传密码中有近8亿个字母. 这几乎是整个水稻基因组信息的三倍. 因此,尝试对这条染色体以及这个基因组进行端到端测序是一项极其复杂的任务."
为了分析海量的遗传信息, 研究人员使用了一种称为鸟枪测序的技术. 这将金沙城js9线路检测中心基因组分成染色体,然后将每个染色体分成更小的片段. 通过短基因序列分析染色体片段,并使用计算机软件将重叠序列缝合在一起.
基于染色体的 daft 序列是对金沙城js9线路检测中心全基因组进行测序之前的关键步骤, 阿胡诺夫说. 针对 3B 染色体开发的测序方法现在可用于对金沙城js9线路检测中心中的其余染色体进行测序. 该联盟估计完整的基因组序列将在三年内提供.
该金沙城js9线路检测中心由美国资助.S. 农业部国立食品农业金沙城js9线路检测中心所.
“小麦是世界上大多数人的主要食物来源. 随着全球人口持续快速增长, 鉴于气候变化,我们需要一切可用的工具来继续为所有人生产足够的粮食, 土地和水资源减少以及饮食和健康期望的改变,”桑尼·拉马斯瓦米说道, 美国农业部国家食品和农业研究所所长,前金沙城js9线路检测中心立大学教员. “这项工作将推动研究人员寻找提高小麦产量的方法."